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内蒙古自治区卫生健康委员会办公室关于印发内蒙古自治区国家致病菌识别网监测工作方案的通知
发布日期:2019年9月4日

 各盟市卫生健康委,自治区综合疾控中心:

按照《国家致病菌识别网工作实施方案》和相关技术文件,结合我区实际,自治区卫生健康委组织制定了《内蒙古自治区国家致病菌识别网监测工作方案》,现印发给你们,请遵照执行。

 

 

2019817

 

内蒙古自治区国家致病菌识别网监测工作方案

 

国家致病菌识别网是由国家卫生健康委员会组织管理、在全国疾控系统建立运行的传染病病原菌实验室监测网络,以网络化信息平台为依托,采用病原体识别、分子分型溯源等调查分析技术,开展病原细菌实验室和流行病学监测,应用于细菌性传染病的防控。通过国家致病菌识别网建设,建立并不断完善适合我国国情的细菌传染病监测模式,推进细菌性传染病监测预警新技术和策略应用,进而提高疫情发现和防控能力。为保障国家致病菌识别网监测工作在我区规范有序开展,特制定本方案。

一、目的

(一)启动建立致病菌实验室网络化监测体系,以国家致病菌识别网为依托,开展传染病病原菌实验室监测和网络建设。

(二)规范和推广致病菌的病原学鉴定、分子分型等新技术,提升网络实验室致病菌鉴定分析能力。

(三)建立和应用致病菌识别网实验室监测信息分析系统。

(四)形成实验室监测整合,应用于流行病学调查与控制的信息和工作平台,在疫情发现、溯源以及突发疫情处置中发挥实验室监测作用。

二、工作内容与要求

(一)实验室监测分析。

1.监测致病菌种类。致病菌识别网常规监测的主要病原菌种类包括传染病法规定管理报告病种的病原细菌、以及非法定但引起公共卫生问题的突发新发传染病病原细菌,主要针对肠道传染病、呼吸道传染病、自然疫源性传染病等。各盟市可以根据本地流行和新发传染病实际情况扩展疾病和致病菌种类。

对于疫情规模大与流行时间长的致病菌、法定高致病性病原菌、新发或地区新发现致病菌或新亚型、特殊耐药菌株,需特别关注并加强实验室监测工作力度。

2.标本和菌株来源及管理。致病菌菌株及其相关信息是致病菌识别网监测分析的基础。标本与菌株来源包括医疗机构病例标本及菌株和疾控系统疾病监测与疫情调查处置相关的标本和菌株。所有菌株和标本必须具有识别网信息系统要求的基本来源信息并及时填报。

自治区综合疾控中心负责做好致病菌菌株建库保藏工作,具备完善的保藏条件、菌株标识和信息记录、取用记录等,应与致病菌识别网信息系统中的分子分型、耐药、流行病学等信息实现唯一关联。

盟市疾控中心网络实验室负责标本的运输和临时保存,按照传染病标本采集、保存、运送的相关具体要求开展工作。

所有标本和致病菌的采集、运送、保藏和检测等各项活动均应当遵守国家相关生物安全管理规定。

盟市疾控中心网络实验室应加强与医疗、出入境检疫、农业畜牧等部门的工作联系,获取识别网实验室监测相关标本、菌株和流行病学信息的收集与记录。

3.监测时间。国家致病菌识别网是开展传染病防控工作中的重要组成部分,纳入疾控日常工作,所有网络实验室全年开展监测分析。

4.工作内容(常规监测实验室分析)。

1)菌株分离培养鉴定。主要对相关病例或环境标本进行菌株分离培养和菌种鉴定,以及血清型/生物型/生化型的实验分析,按照不同病原菌的常规培养鉴定方法进行。

2)抗生素敏感性(耐药性)检测。国家致病菌识别网针对霍乱弧菌、沙门菌、大肠埃希菌、空肠弯曲菌、脑膜炎奈瑟菌、肺炎克雷伯菌、金黄色葡萄球菌、鲍曼不动杆菌等分别确定抗生素种类和检测方法,网络实验室按照国家致病菌识别网的相应的技术标准操作程序进行。耐药性检测涉及的菌种和技术方案将按国家要求持续更新。

3)菌株分子分型。不同病原细菌种或型,采用不同的分子分型方法,主要包括脉冲场凝胶电泳(PFGE)、多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)、多位点序列分型(MLST)、全基因组序列分析等,国家致病菌识别网制订不同致病菌的标准化分子分型操作规程,网络实验室按照标准操作规程开展致病菌分离菌株的分子分型实验和分析。

(二)暴发疫情识别及调查分析。

1.暴发疫情的识别。致病菌识别网需要启动调查的暴发,按照中国疾病预防控制中心制订的突发公共卫生事件相关信息报告标准进行判别。另外,按照暴发及可能暴发发现来源,主要分以下两类:

1)依据流行病学调查确定的聚集性病例,即在局部区域或人群中短时间内集中发生同种疾病的事件、疾病在某一特定区域内未发生过、或者发生疾病的人数超过预期。

2)致病菌具有相同分子分型特征的成簇性事件,即在常规监测中,原则上短时期内(定义为1个月)出现病原细菌的分子分型特征相同的病例数量超过3个或以上、定义为成簇性事件。对于突发公共卫生事件、按照相应规定开展致病菌分析。对于严重或特殊细菌性传染病、以及流行病学聚集指征较明显的病例,在出现2例或以上具有相同病原细菌分子分型特征时,根据疫情情况判断启动暴发识别和调查分析。

2.暴发疫情的调查分析。

1)调查分析要求。对于流行病学确认的暴发疫情,在暴发疫情处置相关工作基础上,实验室工作人员积极参与疫情调查处置,与流行病学人员协作,完成采集标本、记录疫情相关信息,实时开展致病菌的实验室分析。

对于实验室日常监测发现的致病菌成簇性病例,实验室工作人员提出调查需求,会同流行病学人员共同完成标本采集、信息记录工作并及时开展致病菌的实验室分析。

对于涉及多县区、多盟市的暴发流行疫情或病原细菌分子分型成簇病例疫情,由相应上一级疾控中心网络实验室组织跨辖区的实验室联合监测分析。

2)标本采集与运送。盟市疾控中心组织疫情标本的采集和运送,包括医疗机构中的病例标本采集、疫情发生和传播可能因素调查中采集的标本,运送至实验室。

3)实验室分析。由网络实验室完成病原细菌分离鉴定、耐药检测和分子分型。具体实验室分析方法和要求同(1)致病菌识别网常规监测分析。

4)与流行病学信息共享。疫情调查处置中,将实验室监测分析所有信息与流行病学人员共享,开展疫情分析讨论。

(三)监测数据分析与应用。自治区致病菌识别网是以国家致病菌识别网应用信息网络平台为依托,以实验室监测为基础,通过病原识别、致病菌生物型别、分子分型、耐药性、基因组序列等病原生物学指标分析,获得特征数据,建立数据库,利用适宜的数据分析技术,比对分析病原学特征的相关性/相似性,判断致病菌具有共同传染来源的可能性。根据致病菌病原学特征的比对分析结果,以具有共同特征的“成簇”致病菌及其感染者为重点关注对象,结合致病菌来源的流行病学信息,包括人群特征、时空分布、宿主分布以及地理信息分布等,综合运用流行病学的描述性分析和病例对照研究方法,精准追溯传染病暴发疫情的传染来源,及时有效控制传染来源,消除疫情暴发或减少疫情暴发波及范围。

1.常规监测和发现、预警暴发。网络实验室开展日常临床诊疗过程、传染病监测病例菌株的收集、生物型分析和分子分型比对,在致病菌识别网中建立各地区流行菌株的分子分型和耐药基线数据,及时分析和掌握本地区致病菌流行优势型别和新型别、耐药性、以及分子流行病学等方面的动态变化。在常规监测分析基础上,发现具有相同分子型别的菌株,从而提示这些病例可能有共同的感染来源,提出预警,并通过流行病学调查发现可能的暴发。

2.跨地区暴发疫情的追踪溯源。致病菌识别网中不同网络实验室对各自地区内常规监测的致病菌菌株进行分子分型,通过致病菌识别网网络化信息系统进行比对,发现具有相同型别感染菌株、但属于不同地区的病例,从而发现跨地区分布的病例,分析疫情扩散,追踪传播。对发现跨地区分布、具有共同分子分型、且具有流行病学意义的菌株,通过上一级卫生行政和疾控技术机构启动协查。

3.局部暴发疫情的应急处置。在地区内暴发疫情、聚集性事件或新发罕见传染病疫情调查中,对分离菌株进行分子分型等实验室分析,从病原特征层面证实暴发疫情。结合现场流行病学调查,分析疫情传播和发展趋势,开展溯源分析,明确病原传播来源和传播链,指导精确的疫情处置和疾病防控。

4.致病菌耐药性流行趋势分析。网络实验室对所有具有流行病学意义的收集菌株进行多种抗生素耐药性检测,通过时间、空间、人群以及菌株特征分析,确定本地区流行菌株、暴发疫情菌株的耐药特征和变化趋势,为不同地区医疗机构在临床诊疗中针对性用药提供依据,并应用于医疗机构调查、控制和预防院内感染。

5.辅助传染病防控决策。开展致病菌识别网信息分析工作,监测新发再发传染病疫情、聚集性病例和暴发疫情的病原识别、暴发识别以及溯源追踪情况,形成监测数据分析报告,以月报、季报、年报和专报的形式推送至各级卫生健康行政管理部门,充分利用国家致病菌识别网监测信息,制订和调整传染病防控策略以及生物安全防范措施。

(四)常规监测任务。

1.自治区综合疾病预防控制中心。自治区综合疾控中心是国家致病菌识别网自治区中心实验室,负责组织全区致病菌识别网的建设和年度工作计划,入网实验室的质量管理和技术培训。收集全区致病菌识别网监测菌株;并按20%的比例复核鉴定盟市疾病预防控制中心上送菌株、以及全部高致病性、新发、罕见致病菌;按5%的比例复核全区网络实验室的监测菌株耐药谱分析结果;按5%的比例复核全区网络实验室监测菌株的分子分型结果;所有复核任务要均匀分布至每季度进行;完成本单位实验室参与的疫情调查和监测菌株的鉴定、耐药分析和分子分型,并将数据信息和实验室分析结果填报致病菌识别网信息系统,负责全区实验室网络的信息分析和报告。负责上送菌株至中国疾控中心致病菌识别网中心实验室。

2.盟市疾病预防控制中心。盟市疾控中心组织具有致病菌分离培养、鉴定能力的医疗机构作为直属哨点医院(不少于二家),通过哨点医院开展细菌性传染病病例信息收集、标本采集、病原分离培养与鉴定,并将相关记录信息和菌株报送自治区中心实验室。

盟市疾控中心开展实验室检测监测工作,根据自治区中心实验室部署的监测分析任务,并结合本地细菌性传染病防控工作部署,开展肠道感染、呼吸道感染、自然疫源性感染等临床病例的致病菌分离与初步鉴定,另外开展传播环节危险因素的常规监测标本、暴发/其他突发疫情调查标本的收集和病原分离与初步鉴定。

盟市疾控中心全年应完成不少于120株上述来源病原细菌的菌株鉴定/复核,120株菌株应在全年各月份、按病种流行情况大致平均分布;完成不少于100株病原细菌的耐药谱鉴定,其中肠道感染病原细菌不少于80株、其他病原细菌不少于20株;完成不少于120株分离株的分子分型(按不同病原种类选择识别网规定的首选分子分型方法)实验,其中肠道感染病原细菌不少于90株、其他病原细菌不少于30株。

盟市疾控中心菌株复核鉴定工作在接受菌株后1周内完成,对本机构承担的日常监测和疫情调查的标本,应按照实时的要求、尽快完成病原细菌分离鉴定。菌株的耐药谱检测需在获得菌株并鉴定后2周内完成;菌株的分子分型需在鉴定确认后1个月内完成。开展所有收集/采集标本、以及鉴定/复核菌株的信息统计,将数据信息和实验室分析结果填报致病菌识别网信息系统,并将相关菌株上送至自治区中心实验室。

3.哨点医院。国家致病菌识别网监测哨点医院是致病菌识别网重要组成部分,哨点医院负责本院细菌性传染病病例信息收集、标本采集、病原分离培养与鉴定,并按属地疾控中心监测计划,将相关记录信息和菌株报送属地盟市级疾控中心,哨点医院的选择由属地盟市卫生健康委指定,哨点医院有责任和义务提供本院收集的病例信息及培养鉴定的菌株,疾控中心在对哨点医院提供的菌株进行复核鉴定,分子分型检测后,要将检测结果反馈哨点医院。

(五)信息数据填报与分析。自治区综合疾控中心和各盟市疾控中心监测的信息要填报国家致病菌识别网信息系统(http://101.200.213.193:8080/pulsenet),信息系统包括网络用户信息填报、数据存储与分析、信息组织与流通、信息查询和结果获取等。

盟市疾控中心负责哨点医院提供的菌株和样本信息的及时填报和录入工作。盟市疾控中心在完成菌株复核鉴定、生物分型、分子分型和耐药实验后,实时整理填报菌株生物分型、分子分型和耐药检测结果,通过致病菌识别网信息系统传输报告至中心数据库并分析,同时将上述数据反馈辖区内哨点医院

自治区综合疾控中心负责完成需要进行的菌株鉴定、生物分型、分子分型、基因组测序、耐药检测后,及时整理结果数据,通过致病菌识别网信息系统传输至信息系统中心数据库并分析。同时,将数据和结果及时反馈盟市疾控机构。

对暴发疫情和其他突发公共卫生事件、新发或输入性传染病、院内感染聚集性病例等,检测分析信息按有关规定实时报告至疫情处置相关单位,为疫情处置提供深入准确的信息依据。

各级疾控机构定期和不定期开展监测数据分析,每年度统一汇总整理监测数据结果,撰写年度监测分析报告,对重大疫情和区域新发传染病及时撰写分析报告,报送同级卫生健康委疾控处。

信息数据填报与分析方法与流程参见《国家致病菌识别网信息系统用户使用手册》。

三、组织管理与职责分工

(一)卫生健康行政部门。自治区、盟市卫生健康行政部门负责辖区网络监测工作的管理和协调,为其提供必要的政策和经费支持。组织编制辖区致病菌识别网工作方案和计划,定期开展督导检查,加强辖区致病菌识别网建设工作。在确保完成既定监测任务的基础上,可结合辖区实际扩大监测规模。

(二)疾控机构。自治区综合疾控中心负责全区网络监测的组织实施和协调,开展重要致病菌的分子分型、基因组和耐药实验分析,开展入网实验室的技术培训、技术指导和工作质量管理,维护实验室监测网络信息系统,及时发布相关监测数据。

盟市疾控中心开展标本检测和菌株分离,对菌株进行分子分型实验和菌株耐药检测,收集哨点医院相关生物样本基本流行病学信息,完成信息数据填报,并定期报送自治区中心实验室。对辖区监测数据审核、分析和利用,开展技术培训、质量管理、疫情调查与处置。

(三)医疗机构。哨点医疗机构指定专门科室和人员负责致病菌识别网监测工作。按照监测方案要求,开展相关病例信息登记、生物样本采集与保存、实验室检测。发现可疑疫情及时上报,并协助开展流行病学调查。接受辖区疾控中心的技术指导和培训。

四、培训、考核和督导

(一)培训。自治区中心实验室每年组织对全区网络实验室人员的培训。各网络实验室可选派专业技术人员至自治区中心实验室或国家中心实验室进修。

根据致病菌识别网工作需求,自治区中心实验室可派出专家对部分网络实验室所在疾病预防控制中心技术人员进行现场培训和指导。

(二)技术考核和工作评估。

1.考核对象。自治区、盟市致病菌识别网网络实验室,均列为考核和等级评定办法的适用对象。除参加国家疾控中心组织开展的考核外,每年自治区组织考核一次。

2.考核内容。

1)检测监测能力。自治区网络实验室熟练掌握规范化的细菌鉴定、耐药性和耐药基因检测、分子分型技术,熟练操作识别网信息系统,能够完成对所辖网络实验室的相关技术培训;盟市网络实验室熟练掌握规范化的细菌鉴定、耐药性和耐药基因检测、分子分型技术,熟悉信息系统并能及时完成信息填报。

2)监测任务数量。及时准确完成内容与工作要求中的监测分析任务规定的菌株和样本数量要求,完成率100%;菌株鉴定、耐药检测和分子分型等实验均在规定时间内完成;实验室分析工作参与了当年重要暴发疫情调查和应用;信息记录完整,均提交识别网中心数据库。

3)盲样考核。自治区中心实验室结合国家疾控中心的考核对全区网络实验室分发菌株和样品,开展实验室能力测试,内容包括细菌鉴定、分子分型、耐药性和耐药基因检测、实验结果反馈及时性、信息网络传输及时性等方面。

3.考核结果。

1)考核结果划分。考核等级分为优秀、合格、基本合格、不合格四级。

2)考核不合格处置办法。

监测工作考核不合格的网络实验室,由自治区中心实验室提出书面警告和要求整改的通知,并报备盟市级和旗县级卫生健康委。

考核不合格网络实验室三个月之内完成整改、并向自治区中心实验室提交整改报告。

考核不合格实验室的相关检验结果不用于监测结果汇总分析。

连续两年总体考核结果为不合格的网络实验室,退出识别网网络。

对于不合格的实验室,重新组织专家启动网络实验室认定,认定合格后重新作为网络成员开展工作。

4.工作评估。自治区中心实验室参照国家评估方案,制订全区评估方案。每年组织对网络实验室所在的盟市疾控中心、哨点医院的工作进行评估,并将结果报送自治区卫生建康委,自治区卫生健康委通报各盟市卫生健康委。

(三)督导。

1.自治区督导。自治区卫生健康委每年组织对全区部分网络实验室及哨点医院进行督导检查,及时发现问题,提出解决方案,并将督导报告上报国家卫生健康委及中国疾病预防控制中心备案。

2.盟市督导。各盟市卫生健康委负责本辖区哨点医院的日常督导,每年督导2次。

 

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